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转录组测序
转录组测序，对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA在Illumina测序平台进行高通量测序，不仅能够提供定量分析，检测基因表达水平差异，而且能够提供结构分析，发现未知转录本和稀有转录本，精确地识别可变剪切位点、基因融合、SNP以及Indel位点等，也能够不依赖于参考基因组。
技术优势
任意物种的全转录组分析：无需了解物种基因或基因组信息，能够直接对任何物种进行最全面的转录组分析；
覆盖度高：数字化信号，能够测定几乎所有转录本片段的序列；
分辨率高：可以检测基因家族中相似基因及可变剪接造成的单碱基差异；
检测范围广：从几个到数十万个拷贝精确计数，可同时鉴定及定量正常和稀有的转录本。
产品应用
医学方向
农学方向
研究内容
一、无参考序列物种
标准信息分析：
1. 测序数据过滤
2. 转录组de novo组装
3. Unigene七大功能数据库注释
4. Unigene的CDS预测
5. Unigene的TF编码能力预测
6. Unigene的SSR检测
7. Unigene表达量计算（基因表达水平、PCA分析、基因表达水平箱线图和密度图、样品间的表达量韦恩图）
8. 时间序列分析
9. 差异表达基因检测
10. 差异表达基因聚类分析
11. 差异表达基因GO功能分析
12. 差异表达基因Pathway功能分析
13. 差异基因蛋白互作分析
14. 真菌致病基因预测 （真菌样本）
15. 植物抗病基因预测（植物样本）
定制化信息分析：
可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容。
二、有参考序列物种
标准信息分析：
1. 测序数据过滤
2. 参考基因组比对
3. 新转录本预测
4. SNP和INDEL检测
5. 差异剪接基因检测
6. 基因表达量计算（基因比对率及表达数目统计、Reads对转录本的覆盖度及分布、样品间的相关性、PCA分析、样品中基因表达量的分布、样品间及组间的基因表达情况）
7. SNP、INDEL、基因表达量和基因融合Circos图（仅限人的样本）
8. 基因表达量聚类分析
9. 时间序列分析
10. 差异表达基因检测
11. 差异表达基因维恩图分析
12. 差异表达基因层次聚类分析
13. 差异表达基因GO功能分析
14. 差异表达基因Pathway功能分析
15. 差异表达基因TF编码能力预测
16. 差异表达基因蛋白互作分析
高级信息分析：
基因共表达网络分析（15个及以上样品，赠送但不包含在标准执行周期内）
定制化信息分析 ：
可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容
转录组测序，对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA在Illumina测序平台进行高通量测序，不仅能够提供定量分析，检测基因表达水平差异，而且能够提供结构分析，发现未知转录本和稀有转录本，精确地识别可变剪切位点、基因融合、SNP以及Indel位点等，也能够不依赖于参考基因组。
技术优势
任意物种的全转录组分析：无需了解物种基因或基因组信息，能够直接对任何物种进行最全面的转录组分析；
覆盖度高：数字化信号，能够测定几乎所有转录本片段的序列；
分辨率高：可以检测基因家族中相似基因及可变剪接造成的单碱基差异；
检测范围广：从几个到数十万个拷贝精确计数，可同时鉴定及定量正常和稀有的转录本。
产品应用
医学方向
农学方向
研究内容
一、无参考序列物种
标准信息分析：
1. 测序数据过滤
2. 转录组de novo组装
3. Unigene七大功能数据库注释
4. Unigene的CDS预测
5. Unigene的TF编码能力预测
6. Unigene的SSR检测
7. Unigene表达量计算（基因表达水平、PCA分析、基因表达水平箱线图和密度图、样品间的表达量韦恩图）
8. 时间序列分析
9. 差异表达基因检测
10. 差异表达基因聚类分析
11. 差异表达基因GO功能分析
12. 差异表达基因Pathway功能分析
13. 差异基因蛋白互作分析
14. 真菌致病基因预测 （真菌样本）
15. 植物抗病基因预测（植物样本）
定制化信息分析：
可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容。
二、有参考序列物种
标准信息分析：
1. 测序数据过滤
2. 参考基因组比对
3. 新转录本预测
4. SNP和INDEL检测
5. 差异剪接基因检测
6. 基因表达量计算（基因比对率及表达数目统计、Reads对转录本的覆盖度及分布、样品间的相关性、PCA分析、样品中基因表达量的分布、样品间及组间的基因表达情况）
7. SNP、INDEL、基因表达量和基因融合Circos图（仅限人的样本）
8. 基因表达量聚类分析
9. 时间序列分析
10. 差异表达基因检测
11. 差异表达基因维恩图分析
12. 差异表达基因层次聚类分析
13. 差异表达基因GO功能分析
14. 差异表达基因Pathway功能分析
15. 差异表达基因TF编码能力预测
16. 差异表达基因蛋白互作分析
高级信息分析：
基因共表达网络分析（15个及以上样品，赠送但不包含在标准执行周期内）
定制化信息分析 ：
可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容
