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标准化分析 > RNA测序 > smallRNA测序 > smallRNA
smallRNA测序
小RNA是生物体内一类重要的调节分子，包括了miRNA、piRNA、siRNA、snRNA和snoRNA等。其功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，从而调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。利用Illumina测序技术，可一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息，经过生物信息工程师的分析，可鉴定已知小RNA，并预测新的小RNA及其靶标基因。
技术优势
有效数据多：单样本测序数据量可达20M以上；
起始量低：常规样本100ng，最低支持20ng建库起始量；
分辨率高：可检测小RNA单个碱基的差异；
分析经验丰富：完成了数千份数据的分析。
研究内容
一、标准分析
1、数据产出统计，对原始信息采集数据去接头污染，去低质量reads
2、18-30 nt Small RNA 信息采集结果的长度分布
3、Small RNA在选定的参考基因组上的分布(只能选定一个参考基因组)
4、Small RNA分类注释
①Small RNA与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比对信息
②Small RNA与重复序列的比对信息
③Small RNA与exon/intron的比对信息
④Small RNA与miRBase中指定范围的已知的miRNA的比对
⑤miRNA家族分析
⑥动物保守piRNA注释分析(分析仅针对数据库中已有的物种：人、小鼠、斑马鱼、线虫、果蝇、大鼠、鸡、家蚕)
5、Small RNA预测(miRNA/siRNA/piRNA)
6、已知和新Small RNA 定量分析(miRNA/siRNA/piRNA)
7、已知和新Small RNA差异表达分析(miRNA/siRNA/piRNA)
8、已知和新miRNA表达/差异表达聚类分析
9、已知和新miRNA 靶基因预测
10、差异miRNA 靶基因GO 注释和KEGG 通路分析
二、高级分析
1、差异miRNA与差异靶基因的相关性分析；
2、差异miRNA与差异靶基因互作网络绘制；
3、互作靶基因功能富集分析（KEGG和GO）；
三、定制化信息分析
可结合客户的材料与需求，协商确定定制化信息分析内容。
小RNA是生物体内一类重要的调节分子，包括了miRNA、piRNA、siRNA、snRNA和snoRNA等。其功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，从而调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。利用Illumina测序技术，可一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息，经过生物信息工程师的分析，可鉴定已知小RNA，并预测新的小RNA及其靶标基因。
技术优势
有效数据多：单样本测序数据量可达20M以上；
起始量低：常规样本100ng，最低支持20ng建库起始量；
分辨率高：可检测小RNA单个碱基的差异；
分析经验丰富：完成了数千份数据的分析。
研究内容
一、标准分析
1、数据产出统计，对原始信息采集数据去接头污染，去低质量reads
2、18-30 nt Small RNA 信息采集结果的长度分布
3、Small RNA在选定的参考基因组上的分布(只能选定一个参考基因组)
4、Small RNA分类注释
①Small RNA与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比对信息
②Small RNA与重复序列的比对信息
③Small RNA与exon/intron的比对信息
④Small RNA与miRBase中指定范围的已知的miRNA的比对
⑤miRNA家族分析
⑥动物保守piRNA注释分析(分析仅针对数据库中已有的物种：人、小鼠、斑马鱼、线虫、果蝇、大鼠、鸡、家蚕)
5、Small RNA预测(miRNA/siRNA/piRNA)
6、已知和新Small RNA 定量分析(miRNA/siRNA/piRNA)
7、已知和新Small RNA差异表达分析(miRNA/siRNA/piRNA)
8、已知和新miRNA表达/差异表达聚类分析
9、已知和新miRNA 靶基因预测
10、差异miRNA 靶基因GO 注释和KEGG 通路分析
二、高级分析
1、差异miRNA与差异靶基因的相关性分析；
2、差异miRNA与差异靶基因互作网络绘制；
3、互作靶基因功能富集分析（KEGG和GO）；
三、定制化信息分析
可结合客户的材料与需求，协商确定定制化信息分析内容。
