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全基因组DNA甲基化测序
全基因组DNA甲基化测序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS）是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina HiSeq高通量测序平台相结合，对有参考基因组的物种在全基因组水平进行高精准甲基化研究。WGBS可以达到单碱基分辨率，精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态，从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。生物信息分析：
| WGBS | 分析内容 | 解决问题 |
| 标准分析 | 测序数据质量评估 | 过滤掉低质量数据，保证数据质量 |
| 与参考基因组比对 | 比对率和覆盖度分析 | |
| 甲基化位点calling | 分析甲基化位点 | |
| 甲基化分布 | 甲基化在基因组，染色体，功能元件上的分布 | |
| 差异甲基化分析 | 寻找DMR | |
| 相关基因分析 | 相关基因GO，KEGG富集分析 | |
| 多样本分析 | PCA分析多样本甲基化变化规律 |
