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circRNA测序

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 circRNA测序
环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,与传统的线性RNA(linear RNA)不同,circRNA分子合呈封闭环状结构,且不受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解。环状RNA测序能够进行环状RNA的鉴定以及环状RNA与miRNA海绵效应分析, 可实现ceRNA(源竞争RNA)机制等研究。
技术优势
方法灵活:可以使用去核糖体建库测序数据分析环状RNA;
结果可靠采用多种软件对环状RNA进行鉴定和预测;
实验严谨:R酶建库方法稳定,去除线性RNA效率高;
分析经验丰富:完成了数千份数据的分析。
产品应用
 
信息分析内容
一、标准信息分析
      1. 基本数据统计
        1.1去除接头序列、低质量序列得到clean data
        1.2与核糖体数据库比对,去除核糖体RNA数据
      2. 环状RNA预测鉴定
      3. 环状RNA所在线性基因注释
      4. 环状RNA在基因组上的定位
      5. 环状RNA表达定量分析
      6. 样品(组)间表达差异分析
二、高级信息分析
      1. 差异环状RNA来源的基因GO功能及富集分析
      2. 差异环状RNA来源的基因Pathway功能及富集分析
      3. 环状RNA与miRNA互作分析(适用于人/小鼠物种)
 

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